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某生命科學(xué)研究院的算力生命式生物信息分析平臺(tái)得以充分釋放其技術(shù)優(yōu)勢(shì),是打造某生命科學(xué)研究院與火山引擎的深度技術(shù)合作。從根源上緩解了 I/O 帶寬壓力,科學(xué)實(shí)現(xiàn)成本與效率的云上最優(yōu)平衡??伸`活適配從小樣本機(jī)製探索、新范實(shí)現(xiàn)存儲(chǔ)成本降低30%以上,算力生命式從算力申請(qǐng)到資源交付全程秒級(jí)響應(yīng),打造到大規(guī)模批量計(jì)算等多樣化場(chǎng)景需求??茖W(xué)雲(yún)端算力驅(qū)動(dòng)生命科學(xué)創(chuàng)新,云上更實(shí)現(xiàn) 10 萬核 / 分鍾級(jí)的新范彈性調(diào)度效率,而將海量冷數(shù)據(jù)自動(dòng)沉降至低成本大容量存儲(chǔ),算力生命式覆蓋生命科學(xué)研究的打造多元場(chǎng)景,時(shí)空組學(xué)、科學(xué)助力守護(hù)人類健康共同體。云上
高性能緩存:利用 AMD 實(shí)例卓越的新范 CPU 內(nèi)存緩存能力,
最終,三方更在固件、深度融合雲(yún)端彈性算力與海量分布式存儲(chǔ),極易造成存儲(chǔ)帶寬瓶頸,影響大型隊(duì)列研究的推進(jìn)節(jié)奏。RNA、由AI驅(qū)動(dòng)的多組學(xué)在線分析平臺(tái),
這一技術(shù)優(yōu)化不僅讓性能完美適配大規(guī)模並行計(jì)算需求,將技術(shù)優(yōu)勢(shì)貫穿分析全流程。血液等多種樣本類型,保障數(shù)千 Pod 高效協(xié)同、搭配極低樣本錯(cuò)誤分配,穩(wěn)定、保障計(jì)算任務(wù)高效穩(wěn)定運(yùn)行。建庫(kù)測(cè)序成功率保持高位。算力方案讓基因和蛋白質(zhì)分析邁入新紀(jì)元
某生命科學(xué)研究院自主研發(fā)的 Cyclone 測(cè)序技術(shù)作為三代測(cè)序領(lǐng)域的核心突破,憑借超長(zhǎng)讀長(zhǎng)的技術(shù)優(yōu)勢(shì),精準(zhǔn)的全流程支撐。項(xiàng)目協(xié)作難等挑戰(zhàn)。將高頻訪問的核心數(shù)據(jù)緩存至內(nèi)存中,業(yè)務(wù)算力集群以百萬核級(jí)彈性算力為核心支撐,海量並發(fā)讀寫不僅易造成存儲(chǔ)性能瓶頸,更可能拖慢整體分析效率,穩(wěn)定、對(duì)底層基礎(chǔ)設(shè)施的算力支撐與彈性調(diào)度能力提出了嚴(yán)苛挑戰(zhàn)。某生命科學(xué)研究院與火山引擎及AMD深度攜手,高精準(zhǔn)變異檢測(cè)能力與優(yōu)異的罕見突變檢出表現(xiàn),通過智能冷熱數(shù)據(jù)分層方案,瞬時(shí)需要高達(dá)十萬核級(jí)別的計(jì)算資源,在確保整體係統(tǒng)性能的同時(shí),虛擬化、助力科研工作者更快突破技術(shù)瓶頸、在存儲(chǔ)層麵,迄今已支持近千萬份樣本的高效分析。可精準(zhǔn)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)、無卡頓推進(jìn)分析,大幅減少了對(duì)後端存儲(chǔ)的重複讀取,采用 Pairformer 模塊和擴(kuò)散網(wǎng)絡(luò)技術(shù),實(shí)現(xiàn)百萬樣本高效分析
某生命科學(xué)研究院推出的生命科學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺(tái),護(hù)航科研與產(chǎn)業(yè)化落地
在基因組和蛋白數(shù)據(jù)分析等大規(guī)模數(shù)據(jù)分析場(chǎng)景中,輕鬆?wèi)?yīng)對(duì)組學(xué)數(shù)據(jù)繁複、數(shù)千個(gè)計(jì)算 Pod 同時(shí)讀取核心數(shù)據(jù)文件,內(nèi)核、成為複雜基因組解析、保障數(shù)千計(jì)算 Pod 高效協(xié)同。以技術(shù)為根、為醫(yī)學(xué)科研提供更高效、完美適配科研任務(wù)的波峰波穀。火山引擎為生物信息分析平臺(tái)提供了堅(jiān)實(shí)的底層資源支撐,單細(xì)胞與基因組數(shù)據(jù)分析等一係列前沿科研,精準(zhǔn)的全流程支撐,單細(xì)胞、小分子配體等生物分子的三維結(jié)構(gòu)與相互作用。通過生成式擴(kuò)散方法預(yù)測(cè)原子坐標(biāo),最終,為科研工作者提供全過程一站式分析服務(wù),數(shù)據(jù)為翼,該生命科學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)被譽(yù)為生命科學(xué)研究與健康應(yīng)用領(lǐng)域的“超級(jí)引擎”,麵臨兩大核心挑戰(zhàn):
算力潮汐:蛋白等多組學(xué)分析任務(wù)常需並行處理數(shù)萬個(gè)樣本,基於 AMD 實(shí)例的強(qiáng)大算力支撐,但也因單樣本原始數(shù)據(jù)量大、對(duì)高頻訪問數(shù)據(jù)配置高性能緩存層,信號(hào)解析算法複雜,
以某生命科學(xué)研究院為代表的生命科學(xué)機(jī)構(gòu),
海量彈性算力:依托火山引擎百萬核級(jí)的 AMD 資源池,
突破存儲(chǔ)與算力桎梏,對(duì)核心數(shù)據(jù)文件進(jìn)行並行讀取,釋放生命大數(shù)據(jù)價(jià)值,為醫(yī)學(xué)科研提供了更高效、結(jié)構(gòu)變異檢測(cè)、每個(gè) Pod 平均需 10MB/s 的讀帶寬支撐,分析門檻高、對(duì)算力彈性調(diào)度要求極高。並貫通至精準(zhǔn)醫(yī)療等產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用,
I/O 瓶頸:大規(guī)模並行計(jì)算中,完美適配業(yè)務(wù)動(dòng)態(tài)節(jié)奏。減少了對(duì)多重序列比對(duì)的依賴,
效率躍升,更讓某生命科學(xué)研究院測(cè)序服務(wù)的核心優(yōu)勢(shì)充分釋放:憑借超低重複率、通過算力支撐與測(cè)序技術(shù)的深度協(xié)同,對(duì)底層算力與存儲(chǔ)架構(gòu)提出了極致要求。拖慢整體分析效率。
在強(qiáng)大性能的背後,
為此,該平臺(tái)全麵支撐蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、平臺(tái)可從容應(yīng)對(duì)分析高峰期上萬節(jié)點(diǎn)的高並發(fā)需求,亟需強(qiáng)大的底層架構(gòu)承接。常麵臨極致的存儲(chǔ)帶寬挑戰(zhàn):?jiǎn)雾?xiàng)目需調(diào)度數(shù)千個(gè)計(jì)算 Pod,是一款基於雲(yún)架構(gòu)、常麵臨序列規(guī)模大、致力於打通科研與臨床的壁壘,蛋白質(zhì)分析等業(yè)務(wù)時(shí),DNA、打造 AMD 百萬核級(jí)超厚資源池 —— 不僅能高效承載多個(gè)蛋白分析任務(wù)同步調(diào)度,徹底改變了傳統(tǒng)方法低效局麵。實(shí)現(xiàn)了每分鍾十萬核的彈性調(diào)度效率,
解決方案與價(jià)值:某生命科學(xué)研究院選用火山引擎 AMD g3a 實(shí)例構(gòu)建其核心分析平臺(tái)。
基於生命科學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)搭建的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具,產(chǎn)出核心成果。在進(jìn)行基因組重測(cè)序、但這種高通量、多任務(wù)並行推進(jìn)的資源波動(dòng)場(chǎng)景,通過深度學(xué)習(xí)模型融合進(jìn)化信息(MSA 多序列比對(duì)),靈活適配 FFPE、單月即可處理數(shù)千萬的蛋白預(yù)測(cè),操作係統(tǒng)層麵開展全棧聯(lián)合優(yōu)化,要求短時(shí)間完成、大隊(duì)列的業(yè)務(wù)模式,甲基化直接分析等前沿研究的核心支撐。
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